服部半蔵的實際面貌 人們俗稱「服部半蔵」的服部正成是知名度很高的伊賀忍者，但山田教授說「他是名列前茅的神槍手武將」。「父親是伊賀出身，想必會使用忍術吧，但正成是三河國岡崎（愛知縣）出身的。正成本身並非忍者，應該是讓忍者們團結起來的人吧。」
1582年，織田信長於「本能寺之變」身亡後，帶著寡眾滯留在邊界的德川家康，從山中的伊賀路逃回領地岡崎。聽說當時在正成的指令下，伊賀和甲賀的人一路護衛德川家康，但這個說法並非定論。
「關於穿越伊賀的路線主要有三種說法，可以確定的是伊賀和甲賀的人在途中應該是給予許多幫助。 當時可說是家康生涯中最千鈞一髮之際，但史料中沒有正成活躍的記錄。」
不過，伊賀的人們確實擁有家康的深厚信賴， 1590年，他們與家康一同進入江戶，並守護甲州街道的要衝之地。現在皇居西側的半藏門的名稱由來就是因為靠近以前正成家而來的。
「忍者最後的活躍是在『島原之亂』（1637～38）。當幕府軍從事鎮壓活動時，九州的各藩所雇用的忍者們，潛入城內搜尋天草四郎的蹤跡，盜取兵糧，暗中貢獻良多。其中發揮最大效果的是細川藩（熊本）的忍者。他用帶火的箭將四郎的房子燒光。」
忍術的百科辭典『萬川集海』 在和平的江戶時代，忍者的職務也發生了變化，變成維持各地治安、看守門房、護衛藩主等等。
17世紀後半，因為怕口述傳授的技術消失，漸漸出現記載忍術和心得的忍術書。其中也有像是「樹葉隱藏術」等等現實中辦不到，或像是魔咒的忍術，不過大多是提及如何在嚴峻的狀況下求生或如何幫助完成任務的知識。
『萬川集海』（1676年）全長22篇，將伊賀・甲賀的忍術統整為百科辭典。從忍者的心理準備到侵入術、破壞術、武術、變裝術、交際術、天文術等等，記載了各式各樣的忍術。從修驗道衍伸出很多忍術，像是用手刻印的「九字護身法」、火術及藥草知識等等就是其中一部分。另外，書中還將忍者所使用的道具分類成登器、水器、火器等等，並附上製作方法的圖示。
順道一提，利用女色蒐集情報則稱為「Kunoichi術」。「『Kunoichi』並非指女忍者。在史料中並沒有女忍者的記錄，也沒有專門從事忍者的女性。女忍者的出現，只在昭和以後的科幻片中。」
忍術書是智慧的寶庫，許多知識也可以運用於現代社會。
「比如忍者的攜帶保存食品的兵糧丸，材料裡放入對身體很好的人參等補品，『息長』呼吸法也證實對安定精神有很好的效果。這本書從人際關係到醫學、藥學，還有精神面，涵蓋很多現在人能具體實踐的內容。」